L'IMT conduit un programme doctoral pour financer les études de troisième cycle dans l'un des domaines des spécialités suivantes : informatique, décision et sciences des systèmes ; sciences de l'informatique ; systèmes de contrôle ; analyse de l'image ; sciences du management ; économie ; management et développement du patrimoine culturel ; histoire politique. La bourse est équivalente à 13630 euros par année, plus hébergement gratuit, accès à la cantine et prise en charge des frais de scolarité.
Les candidats doivent être des doctorants avec une qualification en adéquation.