L'Institut des Sciences Politiques de Strasbourg remet le Prix Pierre Pflimlin à un projet de thèse de doctorat Français ou Allemand consacré à la construction européenne, dans les domaines des Sciences Humaines et des Sciences Sociales, de la sécurité ou de la défense. Le prix est de 2.500 euros. L'Institut récompense également trois thèses de master sur les mêmes sujets, soutenues aux universités de Strasbourg et de Fribourg. Chaque thèse de master retenue reçoit un prix de 500 euros.
Les candidats doivent remettre leur thèse à l'Institut afin que celle-ci soit prise en compte pour le Prix.