L'Università del Papa John Paul II offre borse di studio per il dottorato. Il dottorato è libero di utilizzare il denaro in qualsiasi modo che ritengano opportuno. Esso è concesso ogni mese per 9 mesi. Dottorandi possono richiedere la borsa di studio indipendentemente dal loro anno di formazione, comunque i requisiti variano tra il primo anno e i rimanenti.
Per dottorato di ricerca il loro primo anno di istruzione, è necessario che essi hanno risultati molto buoni dal processo di recruitation, come pure il grado medio di 4,50 o superiore.
Il dottorato di ricerca che hanno già superato il loro primo anno di formazione, i requisiti sono: avere risultati esami buona o molto buona; avendo mostrato progressi sui loro lavori scientifici e tesi di laurea; avendo dimostrato eccezionale impegno per il lavoro didattico sull'università.